Amber Guide - Бесплатные, углубленные проникновения в Ambertools

Example

Например, если пользователь не понимает, как использовать модуль "sander" в Ambertools для минимизации энергии, Янтарный гид может объяснить его функциональность, синтаксис использования и параметры, как подробно описано в руководстве.

Scenario

Это особенно полезно в ситуациях, когда пользователи впервые сталкиваются с молекулярной динамикой или когда они сталкиваются с незнакомыми функциями в Ambertools.

Example

Если у пользователя возникают проблемы с сходимостью в молекулярно-динамическом моделировании, Янтарный гид может предложить потенциальные причины и решения, например, корректировку размеров шагов по времени или параметров силового поля, как указано в руководстве Ambertools.

Scenario

Эта функция полезна, когда пользователи сталкиваются с техническими проблемами или неожиданными результатами в своих проектах по вычислительной химии.

Example

Янтарный гид может сравнивать различные методы или модули в Ambertools, например, сопоставляя использование "pmemd" и "sander" для определенных типов симуляций, непосредственно по содержанию руководства.

Scenario

Такие сравнительные идеи ценны для пользователей, принимающих решение о наиболее подходящих инструментах или подходах для своих конкретных исследовательских потребностей.