Single Cell Explorer-Herramienta gratuita de análisis de células únicas

Example

Ayudar a interpretar los datos de scRNA-seq, guiando a través de técnicas de reducción de dimensionalidad como t-SNE o UMAP.

Scenario

Un investigador que trabaja con un conjunto de datos de una muestra de tejido heterogéneo podría utilizar esta función para identificar poblaciones celulares distintas y sus perfiles de expresión génica.

Example

Proporcionar información sobre la selección de tecnologías de células únicas apropiadas en función del tipo de muestra y la pregunta de investigación.

Scenario

Un equipo que planea estudiar microambientes tumorales podría necesitar asesoramiento para elegir entre ATAC-seq de célula única y ARN-seq de célula única, considerando sus objetivos específicos.

Example

Sugerir formas efectivas de visualizar conjuntos de datos complejos, como usar mapas de calor o gráficos de violín para datos de expresión génica.

Scenario

Para un investigador que intenta presentar hallazgos sobre heterogeneidad celular de manera clara y comprensible, puedo recomendar y explicar las técnicas de visualización más adecuadas.